1993年经原国家教委批准在华东师范大学成立城市与环境考古遥感开放研究实验室。1998年，校党委决定联合我校软件学院、电子系、地理系等学科的研究力量，重组实验室，并先后从美国、瑞典、日本等国外名校、中国科学院、国内高校等引进优秀人才充实实验室力量。2003年，原开放实验室通过教育部的评审，并正式更名为“地理信息科学教育部重点实验室”。实验室以学科发展与国家和地方重大需求为导向，从地理信息科学的理论与方法、地理空间数据获取技术及GIS软件开发，到地理信息科学技术在城市的应用等方面进行系列研究，属应用基础研究单位。依托该实验室还与中国科学院成立了“环境遥感与数据同化联合实验室”。
